东海县环境保护局下设8个科室和环境监察局、环境监测站、环境科学研究所三家单位以及6个乡镇环保分局，科室包括人秘科、综合计划科、环境管理科、自然生态科、法规科、固废（辐射）科、环境信息科、应急办公室。
（1）人秘科
协助局领导组织协调机关工作；拟定局机关年度工作计划、工作总结、综合性报告并督促实施；负责机关文电处理、会议组织、档案管理、保密、保卫、信访、安全、政务信息和后勤服务等工作；负责局机关及下属事业单位的机构编制、人事管理工作及技术职称改革。
科室负责人：鲁贵齐 联系电话：051887798069
（2）综合计划科
编制全县环境保护中、长期规划和年度计划；编制全县污染物排放总量控制计划和绿色工程规划并组织实施和考核；参与编制我县可持续发展纲要、经济和社会发展规划、区域经济开发规划、环保基础设施建设和环境污染综合治理项目计划；参与审核城市总体规划中的环境保护内容；负责全县环境保护系统基本建设项目、环保示范工程的立项，下达投资计划并监督检查实施情况。归口管理全县排污费的计划、使用和审计工作，编制全县排污收费财务报表、县环保补助资金收支预算和县级污染防治基金使用计划。负责全局财务工作。管理全县环境监理、监测和信息、统计工作。
科室负责人：修春懿 联系电话：051887798056
（3）环境管理科
组织创建国家环境保护模范城市工作。草拟和组织实施大气、水体、噪声、固体废物、有毒化学品以及机动车的污染防治地方行政措施；组织实施城市环境综合整治定量考核、排污申报等级、排污许可证、污染物总量控制、污染源限期治理、危险废物经营许可、行政代执行等环境管理制度；配合有关部门实施污染集中控制，淘汰污染严重的落后工艺和设备；负责编制和组织实施环境功能区划。
负责全县建设项目环境管理工作。组织草拟全县建设项目环境管理地方行政措施；负责审批限额内的基本建设项目、技术改造项目和区域开发项目的环境影响报告书，并对“三同时”情况进行检查验收。
科室负责人：李新响 联系电话：051887798039
（4）自然生态科
组织生态县创建工作。负责农村生态环境保护；组织农村和小城镇环境综合整治；指导全县生态示范区建设和生态农业建设；组织草拟和监督实施自然生态保护地方行政措施；组织拟定生物多样性保护区发展规划；提出新建的各类自然保护区初审意见；监督管理全县自然保护区；监督自然资源开发活动中的环境保护；指导和监督矿区复垦、生态破坏恢复整治和重大生态环境建设；管理生物技术环境安全；保护全县饮用水源；组织对重大生态破坏事故的调查处理。
科室负责人：仲崇艳 联系电话：051887798058
（5）法规科
组织草拟地方性环境保护行政管理规定；组织全县重大环境问题和环保政策研究；组织推行环保目标责任制；组织环境保护行政处罚、行政复议和应诉工作；规范、监督依法行政工作。组织开展对全县贯彻执行国家环境保护法律法规的执法检查。
编制环境保护科学技术发展规划、计划；组织环保科研及环保实用技术的推广；组织推行清洁生产；组织实施环境保护资质认可制度，负责环保产品、环境咨询服务，指导和推动环境保护产业发展；负责环保科技信息工作；组织开展环境宣传、环境教育工作。
科室负责人：邱少军 联系电话：051887798059
（6）固废（辐射）科
科室负责人：韩俊浦 联系电话：051887798076
（7）环境信息科
负责全县环境统计资料的汇总，编写环境统计年鉴；负责全县环境信息的手机、处理、加工及管理；负责全县环境信息系统的建设和管理，通过计算机网络为全局各部门和局直属单位提供办公自动化和信息服务；负责对本辖区内环保局职工提供环境信息支持，对外开展环境信息咨询。
科室负责人：王建军 联系电话：051887798080
（8）应急办公室
科室负责人：苗 壮 联系电话：051887798081
（9）监察局
部门负责人：李树宾 联系电话：051887798036
（10）监测站
部门负责人：袁青松 联系电话：051887212809
（11）环科所
部门负责人：孙宜华 联系电话：051887237611
（12）牛山分局
部门负责人：陈士新 联系电话：051887798096
（13）白塔分局
部门负责人：时红霞 联系电话：051887798078
（14）安峰分局
部门负责人：李 达 联系电话：051887798086
（15）双店分局
部门负责人：刘长迁 联系电话：051887798090
（16）青湖分局
部门负责人：唐文忠 联系电话：051887798079
（17）开发区分局
部门负责人：袁华东 联系电话：051887798077
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